Европейским специалистам по метагеномике удалось восстановить геном возбудителя бруцеллеза бактерии Brucella melitensis, ДНК которой была выделена из 700-летних костных останков, найденных во время раскопок в средневековой сардинской деревушке.

Для реконструкции бактериального генома профессор Марк Пэллен (Mark Pallen) из Школы медицины Уорвикского университета (Великобритания) и его коллеги применили «метод дробовика», используемый при секвенировании длинных участков ДНК. Суть его состоит в дроблении генома на случайные фрагменты, которые затем секвенируют обычными методами. Полученные таким образом перекрывающиеся нуклеотидные последовательности затем собирают с помощью специальных программ в единое целое.

Бактериальная ДНК была выделена из 32 обызвествленных узелков в тазовой области мужского скелета, найденного во время раскопок на руинах сардинской деревни Гериду, оставленной жителями в конце 14 века. «Как правило, когда имеешь дело с кальцифицированным материалом в человеческих или животных останках, речь идет о туберкулезе, поскольку это наиболее распространенная инфекция, ведущая к обызвествлению. Мы были очень удивлены, когда обнаружили, что в данном случае речь идет о бруцеллезе», — отметил Пэллен.

Бруцеллез – инфекционное заболевание, передающееся человеку от больных домашних животных и характеризующееся множественным поражением органов и систем организма. Это заболевание до сих пор распространено в Средиземноморье. Группа Пэллена установила, что средневековый штамм Brucella melitensis генетически близок штаммам, выявленным в Италии в 1961, 2006 и 2007 годах.

Пэллен и его коллеги планируют продолжить применение современных методов метагеномики для выявления патогенов в древних человеческих останках – например, в мумиях, найденных на территории Венгрии, Египта, Корейского полуострова, а также собираются исследовать легочную ткань французской королевы из меровингской династии 5-8 века.